
KEGG 怎么用? - 知乎
9. KEGG NETWORK 这部分和上面的KEGG DISEASE比较像,它是KEGG尝试从扰乱的分子网络中获取有关疾病和药物的信息。 这部分主要包含了癌症、内分泌和代谢性疾病、病毒和细菌感染三部分内 …
为啥目标基因在kegg富集分析时,没有kegg pathway通路,只有kegg …
在进行KEGG富集分析时,如果发现目标基因只富集到了KEGG BRITE分类而不是经典的KEGG pathway,这可能意味着以下几种情况: 1. 数据特异性: 你的基因集可能富含一些较为新颖或特定 …
GO和KEGG分析怎么筛选自己想要的基因啊? - 知乎
GO和KEGG分析怎么筛选自己想要的基因啊? 做了干旱胁迫转录组,做了差异基因GO和KEGG分析,我应该怎么筛选和干旱有关的词条啊? 一般显著的p值低于多少啊,我做的分析里面没有标注显著。 …
求go/kegg富集分析可视化网站 或者方法? - 知乎
其中,KEGG Pathway 子数据库因专门收录不同物种的基因通路信息(也是科研中最常用的模块),才让 “KEGG = 通路分析” 的印象深入人心。 下面我们结合具体实例,带大家看看 GO 三大分类和 KEGG …
「京都基因与基因组百科全书」(KEGG)对于生物学研究的意义是怎 …
Sep 20, 2018 · KEGG和DAVID是目前常用的信号通路查阅网站。 大多数做pathway分析的,都会用到它们。 然而16年Nat Methods就有人比较过这些pathway分析网站:DAVID数据库更新慢,跟不上最新 …
保姆级KEGG数据库教程!医学人如何入门KEGG?信号通路分析必学功 …
Aug 18, 2022 · 1. KEGG PATHWAY 这部分应该就是大家最熟悉的啦,也是KEGG数据库最核心的部分。 它包含了与通路相关的各种信息,我们解螺旋也有相关课程教大家使用,在此就不赘述。 2. KEGG …
单细胞测序中GO、KEGG、GSEA 分析三个高级分析有什么区别?
KEGG分析 原理:KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)是一个综合的数据库,包含基因、蛋白质、代谢通路等信息。KEGG富集分析通过比对基因与KEGG数据库中的通路,确定哪些通 …
请问GO、KEGG、PANTHER、REACTOME和BioCyc这几个数据 ... - 知乎
请问GO、KEGG、PANTHER、REACTOME和BioCyc这几个数据库有什么差别? 医学生做基因分析的时候要用到GO、KEGG、REACTOME、PANTHER和BioCyc等数据库进行分析,这些数据库都是 …
KEGG富集分析结果,应该看p值还是矫正p值呢? - 知乎
Feb 18, 2021 · KEGG富集分析结果,应该看p值还是矫正p值呢? 生信小白,临床大夫,请多包涵~KEGG的结果,大部分p值<0.05,但是矫正p值都>0.05,这样KEGG富集的结果还有意义吗? p …
请问KEGG特异性通路图怎么看? - 知乎
请问KEGG特异性通路图怎么看? 刚入行小白提问,一个物种的KEGG特异性通路图,基因标注有白框的和绿框的。 绿框的是一定存在的基因吗? 白框的是一定不存在的基因吗? 这里面有什么门道吗? …